往來詢證函對不上的處理方式有以下幾點(diǎn)：

1.一般來說，如果由于一些理由無法證明貨物、材料的數(shù)量、質(zhì)量、用量等，可以由雙方認(rèn)可的相關(guān)組織對貨物、材料提供鑒定報(bào)告；

2.鑒定報(bào)告需要包括供應(yīng)商和需求方的名字、地址等信息，采購金額，實(shí)際鑒定的數(shù)量、質(zhì)量、用量以及鑒定人員簽字等；

3.如果雙方無法達(dá)成一致，則可以根據(jù)相關(guān)法律法規(guī)或者簽訂的合同，由法院進(jìn)行裁決；

4.雙方還可以通過專業(yè)的仲裁機(jī)構(gòu)來解決往來詢證函對不上的問題，仲裁機(jī)構(gòu)會根據(jù)供應(yīng)商和需求方提供的證據(jù)，對往來詢證函進(jìn)行綜合評定；

5.如果兩方雙方認(rèn)為往來詢證函的內(nèi)容沒有問題，但額度不一致，則可以以雙方認(rèn)可的付款憑證作為參考，以此為基礎(chǔ)進(jìn)行協(xié)商處理；

6.另外，如果往來詢證函對不上，還可以根據(jù)實(shí)際情況，加上合理的滯納金或者由雙方協(xié)商簽訂減免協(xié)議處理，以此保證雙方權(quán)益。

拓展知識：往來詢證函主要用于雙方貿(mào)易等結(jié)算時(shí)，由雙方有關(guān)部門、部門經(jīng)理等互相確認(rèn)的憑證。往來詢證函的準(zhǔn)確補(bǔ)充是雙方貿(mào)易結(jié)算、稅費(fèi)核算及審計(jì)等的基礎(chǔ)，具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值，是當(dāng)事人應(yīng)盡最大努力的維護(hù)和履行方式之一。