2016年12月25日十二屆全國人大常委會第二十五次會議通過《中華人民共和國環(huán)境保護(hù)稅法》，標(biāo)志著環(huán)境保護(hù)稅正式面世。該稅將于2018年1月1日起施行，這為稅務(wù)機(jī)關(guān)完善相應(yīng)的征管配套措施預(yù)留了空間。當(dāng)前稅務(wù)機(jī)關(guān)需要下大功夫、花大力氣，切實(shí)解決環(huán)境保護(hù)稅如何征管的問題。具體說來，環(huán)境保護(hù)稅的征收，有以下幾個難點(diǎn)：

1、申報審核難。環(huán)境保護(hù)稅法所指的應(yīng)稅污染物，包括《環(huán)境保護(hù)稅稅目稅額表》《應(yīng)稅污染物和當(dāng)量值表》規(guī)定的大氣污染物、水污染物、固體廢物和噪聲。也就是說，征稅對象不再表現(xiàn)為傳統(tǒng)的資金流動或者類似土地、房產(chǎn)等穩(wěn)定的實(shí)物，稅務(wù)機(jī)關(guān)對現(xiàn)金、發(fā)票、實(shí)物以及賬簿管理的監(jiān)控手段失去了施展空間，這給稅務(wù)機(jī)關(guān)申報審核帶來了較大困難。

2、實(shí)時監(jiān)控難。環(huán)境保護(hù)稅法要求應(yīng)稅大氣污染物和水污染物的計稅依據(jù)按照污染物排放量折合的污染當(dāng)量數(shù)確定，應(yīng)稅固體廢物按照排放量確定，應(yīng)稅噪聲按照超過國家規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)的分貝數(shù)確定。僅靠環(huán)境保護(hù)部門傳遞的數(shù)據(jù)不足以保障稅務(wù)機(jī)關(guān)實(shí)施稅額確認(rèn)權(quán)，在確認(rèn)程序中如何審核納稅人申報的正確性和真實(shí)性?一旦發(fā)生納稅爭議，環(huán)境保護(hù)部門承擔(dān)何種責(zé)任也需要考慮。

3、外部依賴度大。信息共享是環(huán)境保護(hù)稅實(shí)現(xiàn)有效征管的保障。從程序上而言，環(huán)境保護(hù)稅應(yīng)由納稅人自行申報，實(shí)現(xiàn)完全意義上的自報自核自繳，但納稅人自行申報的數(shù)據(jù)某種程度上就是環(huán)境保護(hù)部門核定的數(shù)據(jù)，這兩者是重合的。

4、風(fēng)險應(yīng)對難度大。環(huán)境保護(hù)稅所指向的污染物在生產(chǎn)過程中有時稍縱即逝，污染指標(biāo)可能處于起伏不定的狀態(tài)。即，可能某個時點(diǎn)污染超標(biāo)，但此時已不超標(biāo)。對納稅人開展違法調(diào)查，就必須實(shí)地取證，藉以證明納稅人的稅收違法性。但限于污染排放的特點(diǎn)，如何固定證據(jù)，值得探討。