成本估算準確性問題
采用估計成本比例法時，無論是按進度還是按工作量來估計成本，其準確性依賴于對總成本的合理估算。如果估算的總成本與實際情況偏差較大，會導致成本結轉金額不準確。例如，在按進度估計成本比例中，若對總成本估計過高或過低，根據(jù)工程進度計算出的應結轉成本就會偏離實際成本，可能造成當期利潤虛增或虛減。
參考同類型項目成本率法也存在類似問題。如果選取的同類型項目與實際項目在建筑材料質量、施工工藝復雜程度、地理環(huán)境等因素上有差異，那么參考的成本率可能不適用，從而影響成本結轉的準確性。
成本完整性問題
用實際成本法部分成本先結轉，可能會出現(xiàn)成本結轉不完整的情況。因為在工程進行過程中，有些成本可能尚未發(fā)生，如工程尾款對應的成本、質保期內可能發(fā)生的維修成本等。如果只考慮已發(fā)生的成本進行結轉，會導致在項目前期成本結轉不足，后期成本突然增加，影響各期利潤的平穩(wěn)性和成本核算的真實性。
成本與收入匹配問題
由于不知道工程造價，僅依靠合同價來結轉成本，可能會導致成本與收入不匹配。在工程建設中，合同價可能會因工程變更、索賠等情況發(fā)生變化，而如果仍然按照最初的合同價和估計的成本結轉方式，可能出現(xiàn)收入和成本確認的節(jié)奏不一致。例如，工程中途發(fā)生了大量的變更增加了合同價，但成本結轉沒有相應調整，會使當期利潤計算錯誤，不符合配比原則。