1、審理機關(guān)不同。行政復(fù)議是由作出具體行政行為的行政機關(guān)的上級行政機關(guān)審理，而行政訴訟則是由作出具體行政行為的行政機關(guān)所在地的人民法院審理。 
2、法律依據(jù)不同。行政復(fù)議依據(jù)的是《行政復(fù)議法》及《行政復(fù)議法實施條例》，而行政訴訟則是依據(jù)《行政訴訟法》。 
3、程序不同。行政復(fù)議只有一級，即行政復(fù)議決定作出后行政復(fù)議程序即終止，對行政復(fù)議決定不服只能依法向人民法院提起行政訴訟。而行政訴訟則對一審法院作出判決不服還可向上級法院提起上訴。在審理過程中，行政復(fù)議一般是書面審，只有在必要時，才可舉行聽證或當(dāng)面聽取有關(guān)人員意見。而行政訴訟除特殊案件外，一般均可公開審理，且具有交換證據(jù)、法庭調(diào)查、質(zhì)證、辯論等程序。 
行政復(fù)議實行行政首長負(fù)責(zé)制，即行政復(fù)議結(jié)論的決定權(quán)由行政機關(guān)層級審批，行政首長最終決定。而行政訴訟實行合議制。 
4、結(jié)案方式不同。行政復(fù)議可以由行政機關(guān)為申請人和被申請人調(diào)解，申請人與本申請人也可自愿達成和解，而行政訴訟不適用調(diào)解。 
5、審理的內(nèi)容不同。行政復(fù)議既要審查具體行政行為的合法性，也要審查其適當(dāng)性，并可依法作出復(fù)議決定。而行政訴訟原則上只審查具體行政行為的合法性，雖也對適當(dāng)性進行審查，但一般不就行政機關(guān)的具體行政行為的適當(dāng)性作出裁決。 
6、行政復(fù)議不收費，行政訴訟收費。