完稅憑證丟失的處理方法主要有以下幾種： 
 
1. 盡快聯(lián)系完稅機構(gòu)，請求補發(fā)紙質(zhì)憑證。 
2. 向當?shù)囟悇?wù)機關(guān)申請補開稅票，只能補開一次，不能重復(fù)補開。 
3. 提供相關(guān)收據(jù)和憑證，如發(fā)票、合同，向稅務(wù)機關(guān)辦理納稅憑證備案。 
4. 如果納稅憑證僅作為財務(wù)報表歸檔，可以在財務(wù)報表中做出說明，提供稅務(wù)機關(guān)其他證明文件，辦理稅務(wù)機關(guān)備案。 
 
拓展知識：實際上，無論是完稅憑證還是稅票，都有一個有效性期限，無論是用于財務(wù)會計核算還是報稅，都應(yīng)該在有效期內(nèi)用于報稅或財務(wù)會計核算。因此，在完稅憑證丟失的情況下，及時聯(lián)系完稅機構(gòu)補發(fā)紙質(zhì)憑證或向稅務(wù)機關(guān)辦理備案，都是必不可少的步驟。