企業(yè)所得稅法第五十六條規(guī)定，依照企業(yè)所得稅法繳納的企業(yè)所得稅，以人民幣計算。所得以人民幣以外的貨幣計算的，應(yīng)當(dāng)折合成人民幣計算并繳納稅款。企業(yè)所得稅法實施條例第一百三十條規(guī)定，企業(yè)所得以人民幣以外的貨幣計算的，預(yù)繳企業(yè)所得稅時，應(yīng)當(dāng)按照月度或者季度最后一日的人民幣匯率中間價，折合成人民幣計算應(yīng)納稅所得額。年度終了匯算清繳時，對已經(jīng)按照月度或者季度預(yù)繳稅款的，不再重新折合計算，只就該納稅年度內(nèi)未繳納企業(yè)所得稅的部分，按照納稅年度最后一日的人民幣匯率中間價，折合成人民幣計算應(yīng)納稅所得額。經(jīng)稅務(wù)機關(guān)檢查確認，企業(yè)少計或者多計以人民幣以外貨幣計算的所得的，應(yīng)當(dāng)按照檢查確認補稅或者退稅時的上一個月最后一日的人民幣匯率中間價，將少計或者多計的所得折合成人民幣計算應(yīng)納稅所得額，再計算應(yīng)補繳或者應(yīng)退的稅款。 
  因此，該企業(yè)經(jīng)稅務(wù)機關(guān)檢查確認的少計應(yīng)納稅所得額100萬美元，應(yīng)按照檢查確認補稅時上一個月最后一日的人民幣匯率中間價，將少計的所得折合成人民幣計算應(yīng)納稅所得額，再計算應(yīng)補繳的稅款。稅務(wù)機關(guān)確認該公司補稅的時間是2013年6月29日，應(yīng)該按照檢查確認補稅的上一個月最后一日也就是2013年5月31日的美元對人民幣匯率中間價折合人民幣計算應(yīng)納稅所得額。2013年5月31日美元對人民幣匯率中間價為6.1796，企業(yè)不存在尚未彌補的以前年度虧損，該企業(yè)以人民幣計算的少計應(yīng)納稅所得額=100×6.1796= 617.96(萬元)，該企業(yè)適用的企業(yè)所得稅稅率為25%，應(yīng)補繳企業(yè)所得稅額=617.96×25%=154.49(萬元)。