1)總分機(jī)構(gòu)應(yīng)納所得稅額分?jǐn)傆?jì)算比例
依據(jù)《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》（國家稅務(wù)總局公告2012年57號），匯總納稅企業(yè)按照《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》規(guī)定匯總計(jì)算的企業(yè)所得稅，包括預(yù)繳稅款和匯算清繳應(yīng)繳應(yīng)退稅款，50%在各分支機(jī)構(gòu)間分?jǐn)偅鞣种C(jī)構(gòu)根據(jù)分?jǐn)偠惪罹偷剞k理繳庫或退庫；50%由總機(jī)構(gòu)分?jǐn)偫U納，其中25%就地辦理繳庫或退庫，25%就地全額繳入中央國庫或退庫。
總機(jī)構(gòu)按以下公式計(jì)算分?jǐn)偠惪睿?br/>總機(jī)構(gòu)分?jǐn)偠惪?匯總納稅企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納所得稅額×50%
分支機(jī)構(gòu)按以下公式計(jì)算分?jǐn)偠惪睿?br/>所有分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偠惪羁傤~=匯總納稅企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納所得稅額×50%
填報(bào)企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表時(shí)，上述“匯總納稅企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納所得稅額”=表Al00000第31行“實(shí)際應(yīng)納所得稅額”-表Al00000第29行“境外所得應(yīng)納所得稅額”+表Al00000第30行“境外所得抵免所得稅額”。
某分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偠惪?所有分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偠惪羁傤~×該分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偙壤?br/>總機(jī)構(gòu)應(yīng)按照上年度分支機(jī)構(gòu)的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額三個(gè)因素計(jì)算各分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偹枚惪畹谋壤?。上年度分支機(jī)構(gòu)的營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額，是指分支機(jī)構(gòu)上年度全年的營業(yè)收入、職工薪酬數(shù)據(jù)和上年度12月31日的資產(chǎn)總額數(shù)據(jù)，是依照國家統(tǒng)一會計(jì)制度的規(guī)定核算的數(shù)據(jù)。三級及以下分支機(jī)構(gòu)，其營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額統(tǒng)一計(jì)入二級分支機(jī)構(gòu)，三因素的權(quán)重依次為0.35、0.35、0.30。
計(jì)算公式如下：
某分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偙壤?該分支機(jī)構(gòu)營業(yè)收入各分支機(jī)構(gòu)營業(yè)收入之和×0.35+該分支機(jī)構(gòu)職工薪酬各分支機(jī)構(gòu)職工薪酬之和×0.35+該分支機(jī)構(gòu)資產(chǎn)總額各分支機(jī)構(gòu)資產(chǎn)總額之和×0.30
在一個(gè)納稅年度內(nèi)，總機(jī)構(gòu)首次計(jì)算分?jǐn)偠惪顣r(shí)采用的分支機(jī)構(gòu)營業(yè)收入、職工薪酬和資產(chǎn)總額數(shù)據(jù)，與此后經(jīng)過中國注冊會計(jì)師審計(jì)確認(rèn)的數(shù)據(jù)不一致的，不作調(diào)整。
2)總分機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的稅款分?jǐn)傆?jì)算方法
對于按照稅收法律、法規(guī)和其他規(guī)定，總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的，先由總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算全部應(yīng)納稅所得額，然后按上述分?jǐn)傆?jì)算比例，計(jì)算劃分不同稅率地區(qū)機(jī)構(gòu)的應(yīng)納稅所得額，再分別按各自的適用稅率計(jì)算應(yīng)納稅額后加總計(jì)算出匯總納稅企業(yè)的應(yīng)納所得稅總額，最后按上述分?jǐn)傆?jì)算比例，向總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偩偷乩U納的企業(yè)所得稅款。
3)二級分支機(jī)構(gòu)不就地分?jǐn)偫U納企業(yè)所得稅的情形