保稅區(qū)也稱保稅倉庫區(qū)，級別低于綜合保稅區(qū)。這是一國海關(guān)設(shè)置的或經(jīng)海關(guān)批準注冊、受海關(guān)監(jiān)督和管理的可以較長時間存儲商品的區(qū)域。是經(jīng)國務(wù)院批準設(shè)立的、海關(guān)實施特殊監(jiān)管的經(jīng)濟區(qū)域。 
保稅區(qū)的功能定位為“保稅倉儲、出口加工、轉(zhuǎn)口貿(mào)易”三大功能。保稅區(qū)具有進出口加工、國際貿(mào)易、保稅倉儲商品展示等功能，享有“免證、免稅、保稅”政策，實行“境內(nèi)關(guān)外”運作方式，是中國對外開放程度最高、運作機制最便捷、政策最優(yōu)惠的經(jīng)濟區(qū)域之一。 
保稅區(qū)能便利轉(zhuǎn)口貿(mào)易，增加有關(guān)費用的收入。運入保稅區(qū)的貨物可以進行儲存、改裝、分類、混合、展覽和加工制造，但必須處于海關(guān)監(jiān)管范圍內(nèi)。外國商品存入保稅區(qū)，不必繳納進口關(guān)稅，尚可自由出口，只需交納存儲費和少量費用，但如果要進入關(guān)境則需交納關(guān)稅。各國的保稅區(qū)都有不同的時間規(guī)定，逾期貨物未辦理有關(guān)手續(xù)，海關(guān)有權(quán)對其拍賣，拍賣后扣除有關(guān)費用后，余款退回貨主。 
綜合保稅區(qū)是設(shè)立在內(nèi)陸地區(qū)的具有保稅港區(qū)功能的海關(guān)特殊監(jiān)管區(qū)域，由海關(guān)參照有關(guān)規(guī)定對綜合保稅區(qū)進行管理，執(zhí)行保稅港區(qū)的稅收和外匯政策集保稅區(qū)、出口加工區(qū)、保稅物流區(qū)、港口的功能于一身，可以發(fā)展國際中轉(zhuǎn)、配送、采購、轉(zhuǎn)口貿(mào)易和出口加工等業(yè)務(wù)。