第六條匯總納稅企業(yè)按照《企業(yè)所得稅法》規(guī)定匯總計(jì)算的企業(yè)所得稅，包括預(yù)繳稅款和匯算清繳應(yīng)繳應(yīng)退稅款，50%在各分支機(jī)構(gòu)間分?jǐn)?，各分支機(jī)構(gòu)根據(jù)分?jǐn)偠惪罹偷剞k理繳庫(kù)或退庫(kù)；50%由總機(jī)構(gòu)分?jǐn)偫U納，其中25%就地辦理繳庫(kù)或退庫(kù)，25%就地全額繳入中央國(guó)庫(kù)或退庫(kù)。也就是說(shuō)，跨省一級(jí)的總分支機(jī)構(gòu)都必須按照57號(hào)公告進(jìn)行匯總納稅，50%由總機(jī)構(gòu)就地繳納，剩余50%在分支機(jī)構(gòu)間按照3因素分配法即營(yíng)業(yè)收入35%、職工薪酬35%、資產(chǎn)總額30%進(jìn)行分配，注意若總機(jī)構(gòu)為具有主體生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)職能的部門，也視同一個(gè)二級(jí)分支并入分配。
       但是按照57號(hào)公告的相關(guān)規(guī)定第二十四條 以總機(jī)構(gòu)名義進(jìn)行生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)的非法人分支機(jī)構(gòu)，無(wú)法提供匯總納稅企業(yè)分支機(jī)構(gòu)所得稅分配表，也無(wú)法提供本辦法第二十三條規(guī)定相關(guān)證據(jù)證明其二級(jí)及以下分支機(jī)構(gòu)身份的，應(yīng)視同獨(dú)立納稅人計(jì)算并就地繳納企業(yè)所得稅，不執(zhí)行本辦法的相關(guān)規(guī)定。按上款規(guī)定視同獨(dú)立納稅人的分支機(jī)構(gòu)，其獨(dú)立納稅人身份一個(gè)年度內(nèi)不得變更。匯總納稅企業(yè)以后年度改變組織結(jié)構(gòu)的，該分支機(jī)構(gòu)應(yīng)按本辦法第二十三條規(guī)定報(bào)送相關(guān)證據(jù)，分支機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)重新進(jìn)行審核鑒定。
      網(wǎng)友提問(wèn)：對(duì)于企業(yè)所得稅匯總納稅企業(yè)，小型微利企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)中的從業(yè)人數(shù)、資產(chǎn)總額是否包括分支機(jī)構(gòu)的部分？國(guó)家稅務(wù)總局所得稅司副司長(zhǎng)劉寶柱：現(xiàn)行企業(yè)所得稅實(shí)行法人稅制，企業(yè)應(yīng)以法人為納稅主體，計(jì)算從業(yè)人數(shù)、資產(chǎn)總額等指標(biāo)，即匯總納稅企業(yè)的從業(yè)人數(shù)、資產(chǎn)總額應(yīng)包括分支機(jī)構(gòu)的數(shù)據(jù)。包含分支機(jī)構(gòu)的匯總納稅企業(yè)從業(yè)人數(shù)、資產(chǎn)總額和應(yīng)納稅所得額如超過(guò)小型微利企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)，自然不能享受小型微利企業(yè)所得稅優(yōu)惠。由總機(jī)構(gòu)匯總納稅和與各分支機(jī)構(gòu)盈虧相抵賦予總機(jī)構(gòu)稅收監(jiān)管責(zé)任。