按照應征差額扣除后不含稅銷售額的稅費填寫，具體計算方法為
應納稅額=差額扣除后不含稅銷售額×征收率，其中，差額扣除后不含稅銷售額=差額扣除后含稅銷售額÷（1+征收率），而差額扣除后本期含稅銷售額＝全部含稅收入－本期差額扣除金額。

差額征稅申報要求
1.選擇簡易計稅方法差額征稅
在《增值稅納稅申報表（小規(guī)模納稅人適用）附列資料》中，將支付的分包款填入“應稅行為（5%征收率）扣除額計算”第10欄“本期發(fā)生額”。
將自開和代開的增值稅普通發(fā)票、增值稅專用發(fā)票開具的價稅合計填入“應稅行為（5%征收率）計稅銷售額計算”第13欄“全部含稅收入（適用5%征收率）”。
在《增值稅納稅申報表》中，將《增值稅納稅申報表（小規(guī)模納稅人適用）附列資料》“應稅行為（5%征收率）計稅銷售額計算”第16欄“不含稅銷售額”填入第4行“（二）應征增值稅不含稅銷售額（5%征收率）”“本期數”“服務、不動產和無形資產”列。
將代開的增值稅專用發(fā)票開具的金額填報申報表第5行“稅務機關代開的增值稅專用發(fā)票不含稅銷售額”“本期數”“服務、不動產和無形資產”列。
將自開和代開的增值稅普通發(fā)票開具的金額填報申報表第6行“稅控器具開具的普通發(fā)票不含稅銷售額”“本期數”“服務、不動產和無形資產”列。
2.選擇簡易計稅方法
在《增值稅納稅申報表》中，將自開和代開的增值稅普通發(fā)票、增值稅專用發(fā)票開具的金額合計填入第1行“（一）應征增值稅不含稅銷售額（3%征收率）”“本期數”“服務、不動產和無形資產”列。
將代開的增值稅專用發(fā)票開具的金額填入申報表第2行“稅務機關代開的增值稅專用發(fā)票不含稅銷售額”“本期數”“服務、不動產和無形資產”列。
將自開和代開的增值稅普通發(fā)票開具的金額填入申報表第3行“稅控器具開具的普通發(fā)票不含稅銷售額”“本期數”“服務、不動產和無形資產”列。