新《企業(yè)所得稅年度納稅申報表》共有一張主表、十三張附表（指一般性企業(yè)。金融企業(yè)、事業(yè)單位、社會團體、民辦非企業(yè)單位的填表說明及表與表之間的勾稽比較簡單明朗，本文不再贅述。），掌握主表與附表項目之間的數(shù)字勾稽關系，對正確填報《企業(yè)所得稅年度納稅申報表》、提高報表質量具有重要指導意義。現(xiàn)根據(jù)《國家稅務總局關于修訂企業(yè)所得稅納稅申報表的通知》（國稅發(fā)〔2006〕56號）和《國家稅務總局關于明確企業(yè)所得稅納稅申報表執(zhí)行口徑等有關問題的通知》（國稅函〔2006〕1043號）介紹如下。
  主表第1行銷售（營業(yè)）收入：填報附表一《銷售（營業(yè)）收入及其他收入明細表》第1行的“銷售（營業(yè)）收入”合計數(shù)，金額等于“主營業(yè)務收入”、“其他業(yè)務收入”和“視同銷售收入”三項合計數(shù)。同時它也是企業(yè)計算業(yè)務招待費、業(yè)務宣傳費和廣告費支出稅前扣除限額的基數(shù)。
  主表第2行投資收益：填報附表三《投資所得（損失）明細表》第4列第17行“投資收益（持有收益）”合計數(shù)。金額等于各類債權投資、股權投資利息收入合計。對主要從事對外投資的納稅人，其投資所得即為主營業(yè)務收入，填入第1行“銷售（營業(yè)）收入”項下的“主營業(yè)務收入”中。
  主表第3行投資轉讓凈收入：填報附表三《投資所得（損失）明細表》第6列第17行“投資轉讓凈收入”合計數(shù)。金額等于轉讓、出售、處置各項債權投資和股權投資資產凈收入合計。
  主表第5行其他收入：填附表一《銷售（營業(yè)）收入及其他收入明細表》第16行“其他收入”合計數(shù)。金額等于“營業(yè)外收入”和“稅收上應確認的其他收入”兩項內容合計。
  主表第7行銷售（營業(yè)）成本：填報附表二《成本費用明細表》第1行“銷售（營業(yè)）成本”合計數(shù)。金額等于“主營業(yè)務成本”、“其他業(yè)務支出”、“視同銷售成本”三項內容合計。并分別與附表一《銷售（營業(yè)）收入及其他收入明細表》“主營業(yè)務收入”、“其他業(yè)務收入”、“視同銷售收入”對應行次的數(shù)據(jù)配比。
  主表第9行期間費用：填報表二《成本費用明細表》第29行“期間費用”合計數(shù)，金額等于“銷售（營業(yè)）費用”、“管理費用”和“財務費用”三項內容合計。
  主表第10行投資轉讓成本：填報附表三《投資所得（損失）明細表》第9列第17行“投資轉讓成本”合計數(shù)。金額等于轉讓、出售、處置各項債權投資和股權投資資產“初始投資成本”（第7列）和“計稅成本調整”（第8列）合計。
  主表第11行其他扣除項目：填報表二《成本費用明細表》第17行“其他扣除項目”合計數(shù)。金額等于“營業(yè)外支出”與“稅收上應確認的其他成本費用”兩項內容合計。
  主表第14行納稅調整增加額：填報附表四《納稅調整增加項目明細表》第3列第41行“納稅調增金額”合計數(shù)。
  主表第15行納稅調整減少額：填報附表五《納稅調整減少項目明細表》第21行合計數(shù)。
  主表第17行彌補以前年度虧損：填報附表六《稅前彌補虧損明細表》第10列第6行“本年度可彌補的虧損額”本年數(shù)，但不得超過主表第16行“納稅調整后所得”數(shù)。并分別與附表一《銷售（營業(yè)）收入及其他收入明細表》“營業(yè)外收入”和“稅收上應確認的其他收入”對應行次的數(shù)據(jù)配比。
  主表第18行免稅所得：填報附表七《免稅所得及減免稅明細表》第1行“免稅所得”額。但不得超過主表第16行“納稅調整后所得”減17行“彌補以前年度虧損”后的差額。
  主表第20行允許扣除的公益救濟性捐贈額：填報附表八《捐贈支出明細表》第5列第1行“允許稅前扣除的公益救濟性捐贈額”和“公益救濟性捐贈額”合計數(shù)。金額等于全額扣除和各按比例扣除項目捐贈額合計。
  主表第26行境外所得應納所得稅額：填報附表九《境外所得稅抵扣計算明細表》第7列“境外所得應納稅額”合計數(shù)。
  主表第27行境外所得抵免稅額：根據(jù)附表九《境外所得稅抵扣計算明細表》分為以下幾種情況填報。當境外已繳納所得稅款按分國不分項抵扣，且第8列“境外已繳納的所得稅稅額”合計數(shù)小于等于第9列“境外所得稅扣除限額”合計數(shù)時，填報第8列“境外已繳納的所得稅稅額”合計數(shù)與第11列“本年可抵扣以前年度所得稅額”的合計數(shù)，但不得超過第9列“境外所得稅扣除限額”合計數(shù)。如第8列“境外已繳納的所得稅稅額”合計數(shù)大于第9列“境外所得稅扣除限額”合計數(shù)，則填報第9列“境外所得稅扣除限額”合計數(shù)。當境外已繳納所得稅款按定率抵扣時，則填報第13列“定額抵扣額”合計數(shù)（這時納稅人不填報第8至11列數(shù)據(jù)）。
  主表第29行減免所得稅額：填報附表七《免稅所得及減免稅明細表》第10行“減免稅”合計數(shù)與第62行“抵免所得稅額”合計數(shù)。