在系統(tǒng)查詢出需要作廢電子發(fā)票后，確認即可作廢。當月開出的發(fā)票只能在當月作廢，跨月不能作廢。已記帳的發(fā)票不能作廢，必須作廢含有該條發(fā)票信息的記帳清單后才能作廢發(fā)票。作廢發(fā)票時應保管好紙質發(fā)票實物，并把作廢電子發(fā)票的代碼和號碼記錄在紙質發(fā)票上，次月14日前交稅務機關驗銷。
           注意《地方稅發(fā)票業(yè)戶使用情況表》上要寫明發(fā)票左下角流水號和發(fā)票右上角的代碼號碼。如電子發(fā)票數(shù)據(jù)作廢但紙質電子發(fā)票未打印的，必須查詢出作廢電子發(fā)票代碼、號碼并寫在作廢紙質發(fā)票實物上（二維碼不抄寫）,同時注明“作廢”字樣。